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Portes ouvertes

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L'ÉTS vous donne rendez-vous à sa journée portes ouvertes qui aura lieu sur son campus à l'automne et à l'hiver : Samedi 18 novembre 2023 Samedi 17 février 2024 Le dépôt de votre demande d'admission à un programme de baccalauréat ou au cheminement universitaire en technologie sera gratuit si vous étudiez ou détenez un diplôme collégial d'un établissement québécois.

Accueil / Études / Portes ouvertes

Sylvain Bouix

Professeur

Département
Département de génie logiciel et TI
Bureau
A-3418
Courriel
sylvain.bouix@etsmtl.ca
Professeur souriant appuyé sur une balustrade dans un bâtiment moderne.

Axe de recherche

  • Technologies de la santé

Expertises

  • Imagerie médicale
  • Neuroimagerie
  • Neuroinformatique
  • IRM anatomique et de diffusion

Cours

LOG680 Introduction à l'approche DevOps
3 crédits Automne 2023
LOG680 Introduction à l'approche DevOps
3 crédits Hiver 2024
LOG680 Introduction à l'approche DevOps
3 crédits Été 2024

Encadrements

  • En codirection avec :
    Interactive Segmentation of the Neuroanatomy from MRI, par Danaee,Ghazal
    Automne 2024
  • En codirection avec : Ebrahimi-Kahou, Samira
    Contrôle de qualité automatisé de l'imagerie par résonance magnétique (IRM) du cerveau humain par l'apprentissage profond, par Bricout,Charles
    Automne 2024

  • En codirection avec : Desrosiers, Christian
    Artifact and Distortion Correction in Diffusion Magnetic Resonance Imaging (dMRI) Dataset through the Application of Deep Learning Techniques, par Dargahi,Sedigheh
    Automne 2024
  • En codirection avec :
    Innovative MRI Cortical Surface Modeling: Unifying Graph and Convolutional Neural Networks for Precise Surface Extraction and Parcellation, par Moradkhani,Kaveh
    Automne 2024

Publications

  • Hastings Greer, Lin Tian, François-Xavier Vialard, Roland Kwitt, Sylvain Bouix, Raul San Jose Estepar, Richard Rushmore, Marc Niethammer. 2023 « Inverse consistency by construction for multistep deep registration ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2023 : 26th International Conference, Proceedings (Vancouver, BC, Canada, Oct. 08-12, 2023) Springer Science and Business Media Deutschland GmbH
  • L. Tian, H. Greer, F. X. Vialard, R. Kwitt, R. S. J. Estépar, R. J. Rushmore, N. Makris, S. Bouix, M. Niethammer. 2023 « GradICON: Approximate diffeomorphisms via gradient inverse consistency ». IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR) (Vancouver, BC, Canada, June 17-24, 2023) IEEE Computer Society
  • Matt Higger, Demian Wassermann, Martha Shenton, Sylvain Bouix. 2020 « Agglomerative region-based analysis ». IEEE 17th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) (Iowa City, IA, USA, Apr. 03-07, 2020) IEEE Computer Society
  • Matt Higger, Martha Shenton, Sylvain Bouix. 2018 « Pairwise, ordinal outlier detection of traumatic brain injuries ». Brainlesion: Glioma, Multiple Sclerosis, Stroke and Traumatic Brain Injuries : Third International Workshop, BrainLes 2017, Held in Conjunction with MICCAI 2017 (Quebec City, QC, Canada, Sept. 14, 2017) Springer Verlag
  • Sylvain Bouix, Sophia Swago, John D. West, Ofer Pasternak, Alan Breier, Martha E. Shenton. 2017 « Evaluating acquisition time of rfmri in the human connectome project for early psychosis. How much is enough? ». Connectomics in NeuroImaging : First International Workshop, CNI 2017, Held in Conjunction with MICCAI 2017 : Proceedings (Quebec City, QC, Canada, Sept. 14, 2017) Springer Verlag
  • Timothy Gebhard, Inga Koerte, Sylvain Bouix. 2015 « Sample size estimation for outlier detection ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2015 : 18th International Conference : Proceedings, Part III (Munich, Germany, Oct. 05-09, 2015) Springer Verlag
  • H. Mirzaalian, A. De Pierrefeu, P. Savadjiev, O. Pasternak, S. Bouix, M. Kubicki, C. F. Westin, M. E. Shenton, Y. Rathi. 2015 « Harmonizing diffusion MRI data across multiple sites and scanners ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2015 : 18th International Conference, Proceedings, Part I (Munich, Germany, Oct. 05-09, 2015) Springer Verlag
  • Matineh Shaker, Deniz Erdogmus, Jennifer Dy, Sylvain Bouix. 2015 « Sparse model learning for high dimensional diffusion MRI data in traumatic brain injury ». IEEE 25th International Workshop on Machine Learning for Signal Processing (MLSP) (Boston, MA, USA, Sept. 17-20, 2015) IEEE Computer Society
  • Yi Gao, Sylvain Bouix. 2014 « Signed poisson map for shape analysis ». IEEE 11th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) (Beijing, China, Apr. 29-Mai 02, 2014) Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc.
  • Yi Gao, Allen Tannenbaum, Sylvain Bouix. 2014 « A framework for joint image-and-shape analysis ». SPIE Medical Imaging 2014 : Image Processing (San Diego, CA, USA, Feb. 15-20, 2014) SPIE
  • Yi Gao, Liang-Jia Zhu, Sylvain Bouix, Allen Tannenbaum. 2014 « Interpolation of longitudinal shape and image data via optimal mass transport ». SPIE Medical Imaging 2014 : Image Processing (San Diego, CA, USA, Feb. 15-20, 2014) SPIE
  • Yi Hong, Yi Gao, Marc Niethammer, Sylvain Bouix. 2014 « Depth-based shape-analysis ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2014 : 17th International Conference, Proceedings, Part III (Boston, MA, USA, Sept. 14-18, 2014) Springer Verlag
  • P. Savadjiev, Y. Rathi, S. Bouix, A. R. Smith, R. T. Schultz, R. Verma, C. F. Westin. 2013 « Combining surface and fiber geometry: An integrated approach to brain morphology ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2013 : 16th International Conference, Proceedings, Part I (Nagoya, Japan, Sept. 22-26, 2013) Springer-Verlag
  • Yi Gao, Sylvain Bouix. 2012 « Synthesis of realistic subcortical anatomy with known surface deformations ». Mesh Processing in Medical Image Analysis 2012 : MICCAI 2012 International Workshop, MeshMed 2012 : Proceedings (Nice, France, Oct. 01, 2012) Springer
  • T. Riklin Raviv, Y. Gao, J. J. Levitt, S. Bouix. 2012 « Statistical shape analysis for population studies via level-set based shape morphing ». Computer Vision -- ECCV 2012. Workshops and Demonstrations, Proceedings, Part I (Florence, Italy, Oct. 07-13, 2012) Springer Verlag
  • P. Savadjiev, Y. Rathi, S. Bouix, R. Verma, C. F. Westin. 2012 « Multi-scale characterization of white matter tract geometry ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2012 : 15th International Conference, Proceedings, Part III (Nice, France, Oct. 01-05, 2012) Springer Verlag
  • D. Forsberg, Y. Rathi, S. Bouix, D. Wassermann, H. Knutsson, C. F. Westin. 2011 « Improving registration using multi-channel diffeomorphic demons combined with certainty maps ». Multimodal Brain Image Analysis : First International Workshop, MBIA 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011 : Proceedings (Toronto, ON, Canada, Sept. 18, 2011) Springer
  • Y. Rathi, O. Michailovich, K. Setsompop, S. Bouix, M. E. Shenton, C. F. Westin. 2011 « Sparse multi-shell diffusion imaging ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2011 : 14th International Conference, Proceedings, Part II (Toronto, ON, Canada, Sept. 18-22, 2011) Springer
  • D. Wassermann, Y. Rathi, S. Bouix, M. Kubicki, R. Kikinis, M. Shenton, C. F. Westin. 2011 « White matter bundle registration and population analysis based on Gaussian processes ». Information Processing in Medical Imaging : 22nd International Conference, IPMI 2011, Proceedings (Kloster Irsee, Germany, July 03-08, 2011) Springer-Verlag
  • Y. Rathi, J. Malcolm, S. Bouix, R. McCarley, L. Seidman, J. Goldstein, C. F. Westin, M. E. Shenton. 2010 « Disease classification: A probabilistic approach ». IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (Rotterdam, Netherlands, Apr. 14-17, 2010) IEEE
  • P. Savadjiev, G. Kindlmann, S. Bouix, M. E. Shenton, C. F. Westin. 2009 « Local white matter geometry indices from diffusion tensor gradients ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2009 : 12th International Conference, Proceedings, Part I (London, England, Sept. 20-24, 2009) Springer-Verlag
  • Yogesh Rathi, Oleg Michailovich, Sylvain Bouix, Martha Shenton. 2008 « Directional functions for orientation distribution estimation ». 5th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (Paris, France, May 14-17, 2008) IEEE
  • Yogesh Rathi, Oleg Michailovich, Sylvain Bouix, Martha E. Shenton. 2008 « Orientation distribution estimation for Q-ball imaging ». IEEE Computer Society Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops (Anchorage, AK, USA, June 23-28, 2008) IEEE
  • M. Niethammer, M. Reuter, F. E. Wolter, S. Bouix, N. Peinecke, M. S. Koo, M. E. Shenton. 2007 « Global medical shape analysis using the Laplace-Beltrami spectrum ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2007 : 10th International Conference, Proceedings, Part I (Brisbane, Australia, Oct. 29-Nov. 02, 2007) Springer Verlag
  • Marc Niethammer, Sylvain Bouix, Santiago Aja-Fernández, Carl-Fredrik Westin, Martha E. Shenton. 2007 « Outlier rejection for diffusion weighted imaging ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2007 : 10th International Conference, Proceedings, Part I (Brisbane, Australia, Oct. 29-Nov. 02, 2007) Springer Verlag
  • Martin Reuter, Marc Niethammer, Franz-Erich Wolter, Sylvain Bouix, Martha Shenton. 2007 « Global medical shape analysis using the volumetric Laplace spectrum ». International Conference on Cyberworlds (CW'07) (Hannover, Germany, Oct. 24-26, 2007) IEEE
  • M. Niethammer, R. S. J. Estepar, S. Bouix, M. Shenton, C. F. Westin. 2006 « On diffusion tensor estimation ». International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (New York City, NY, USA, Aug. 30-Sept. 03, 2006) IEEE
  • Marc Niethammer, Sylvain Bouix, Carl-Fredrik Westin, Martha E. Shenton. 2006 « Fiber bundle estimation and parameterization ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2006 : 9th International Conference, Proceedings, Part II (Copenhagen, Denmark, Oct. 01-06, 2006) Springer Verlag
  • Marcos Martin-Fernandez, Sylvain Bouix, Lida Ungar, Robert W. McCarley, Martha E. Shenton. 2005 « Two methods for validating brain tissue classifiers ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2005 : 8th International Conference, Proceedings, Part I (Palm Springs, CA, USA, Oct. 26-29, 2005) Springer
  • Kilian M. Pohl, Sylvain Bouix, Martha E. Shenton, Eric L. Grimson, Ron Kikinis. 2005 « Automatic segmentation using non-rigid registration ». 8th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2005 Short Papers (Palm Springs, CA, USA, Oct. 26-29, 2005)
  • S. Bouix, L. Ungar, C. C. Dickey, R. W. McCarley, M. E. Shenton. 2004 « Evaluating automatic brain tissue classifiers ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2004 : 7th International Conference : Proceedings, Part II (Saint-Malo, France, Sept. 26-29, 2004) Springer Verlag
  • H. Haidar, S. Bouix, J. Levitt, C. Dickey, R. W. McCarley, M. E. Shenton, J. S. Soul. 2004 « Characterizing the shape of anatomical structures with poisson's equation ». Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2004 : 7th International Conference : Proceedings, Part I (Saint-Malo, France, Sept. 26-29, 2004) Springer Verlag
  • H. Haidar, S. Bouix, J. Levitt, R. W. McCarley, M. E. Shenton, J. S. Soul. 2004 « An elliptic PDE approach for shape characterization ». The 26th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (San Francisco, CA, USA, Sept. 01-05, 2004) IEEE
  • K. M. Pohl, S. Bouix, R. Kikinis, W. E. L. Grimson. 2004 « Anatomical guided segmentation with non-stationary tissue class distributions in an expectation-maximization framework ». 2nd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: Macro to Nano (Arlington, VA, USA, Apr. 15-18, 2004) IEEE
  • S. Bouix, K. Siddiqi, A. Tannenbaum. 2003 « Flux driven fly throughs ». IEEE Computer Society Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR) (Madison, WI, USA, June 18-20, 2003) IEEE
  • L. Zhu, S. Haker, A. Tannenbaum, S. Bouix, K. Siddiqi. 2002 « Angle-preserving mapping for the visualization of multi-branched vessels ». Proceedings. International Conference on Image Processing (Rochester, NY, USA, Sept. 22-25, 2002) IEEE
  • S. Bouix, K. Siddiqi. 2000 « Computing medial surfaces ». Discrete Mathematical Problems with Medical Applications, Proceedings of a DIMACS Workshop American Mathematical Society
  • Sylvain Bouix, Kaleem Siddiqi. 2000 « Divergence-based medial surfaces ». Computer Vision - ECCV 2000 : 6th European Conference on Computer Vision Dublin, Ireland, June 26 - July 1, 2000 Proceedings, Part I (Dublin, Ireland, June 26-July 01, 2000) Springer Verlag
  • Kaleem Siddiqi, Sylvain Bouix, Allen Tannenbaum, Steven W. Zucker. 1999 « Hamilton-Jacobi skeleton ». Proceedings of the Seventh IEEE International Conference on Computer Vision (Kerkyra, Greece, Sept. 20-27, 1999) IEEE

  • Sylvain Bouix. 2003 « Medial surfaces ». 199 p.Thèse de doctorat. Montréal, McGill University.

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